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首先考慮膜與試劑的化學兼容性，是水溶液還是有機試劑。過濾器裝置必須和樣品的化學性質全部相容。一些過濾膜含有可能對一些應用造成干擾的無 毒的潤濕劑。另一些濾膜可能結合蛋白質或其它大分子，從而導致過濾器過早堵塞或高價值 樣品的損失。因此，了解樣品性質以及濾膜對與之接觸的溶液的潛在影響是非常重要的。
微孔濾膜可以按照材質進行分類：
NYLON：尼龍膜 - 水性生物學溶液、醇類溶液和非水 HPLC/GC 溶劑，DMSO
PES: 聚醚砜膜 - 過濾水性溶液，培養基，藥物溶液和混合物
CA: 醋酸纖維素 - 過濾緩沖液、水性試劑和溶液
SFCA：無表面活性劑的醋酸纖維素膜-免疫學樣品和生物液體
MCE:混合纖維素 - 在水性溶液或空氣中截留顆粒并捕獲細胞
PTFE: 聚四氟乙烯 - 去除溶劑和氣體中的顆粒
PVDF: 液體除菌過濾和生物制品過濾
非常適合過濾水性生物學溶液、醇類溶液和非水 HPLC/GC 溶劑。本質上是親 水性的，推薦用于對可提取物含量要求非常低的應用，因為它們不含任何潤濕劑、清潔劑或 表面活性劑。尼龍膜的耐化學性能較強，適于過濾腐蝕性較大的溶液，例如醇類和 DMSO。但是，和硝酸纖維素膜一樣，尼龍膜結合蛋白質和其它大分子的能力強于醋酸纖維素膜或聚 醚砜膜。耐堿不耐酸。
PES 聚醚砜膜
強烈推薦用于過濾細胞培養基。濾膜具有zui低的蛋白結合能力、超低的浸出物 含量以及高流速，是過濾培養基的di一選。PES 膜的流速也高于纖維素或尼龍膜。
適于過濾緩沖液、水性試劑和溶液，包括 EIA 和 ELISA 樣品。濾膜具有 低蛋白結合能力及浸出物含量，非常適合過濾緩沖液。
常用于免疫學樣品和生物液體。濾膜具有低蛋白結合 能力、比標準 CA 濾膜更低的浸出物含量，可用于過濾細胞培養液體和細胞溶液
具有高度的非特異性吸附性能，適用于許多常用的實驗室應用。親水性， 對稱的結構使其能夠實現高流速，還能與水性溶液（pH 4 至 8）、碳氫化合物以及其他幾種 有機溶劑相容
本質上是疏水性的，適于過濾氣體，包括增濕的空氣。特氟龍膜的耐化 學性很好，這使其非常適于過濾其它濾膜不能過濾的溶劑或其它腐蝕性化學品，是溶劑和腐 蝕性酸堿的理想選擇。由于其疏水性，特氟龍膜在過濾水性溶液以前必須用溶劑（例如乙醇） 預先潤濕。
能夠耐受 pH 2-10 的溶液，耐有機溶劑性能較好，具有良好的抗腐蝕、 耐氧化性能和耐熱性能，常用于液體除菌過濾和生物制品過濾。不能耐受丙酮， DMSO， THFDMF，二氯甲烷，氯仿等。
孔徑通常由您的應用或使用目的來決定。支原體可以用 0.1μM 孔過濾器去除。大多數培養 基、緩沖溶液、生物液和氣體的常規實驗室除菌通常采用 0.2 或 0.22μM 孔過濾器完成。溶 液和溶劑的澄清和預過濾常用 0.45μM 或更大孔徑的過濾膜操作。為改進過濾器性能而進 行的預過濾也可用單獨購買的玻璃纖維預過濾器完成。
第三步：過濾的液體量
13mm 過濾 2-10ml
25mm 過濾 10-100ml（預過濾zui高可達 200ml）
50mm 過濾 0.2-5L
過濾的實際體積際取決于溶液本身以及它堵塞膜的速度。不含大量顆粒或大量蛋白質的相對 清澈的溶液會更容易過濾，因此允許更多的體積有效通過膜。另一方面，高顆粒數的溶液可 能在通過幾毫升后就堵塞了膜。對于細胞培養基，血清或蛋白質的數量會對流速和過濾量產 生影響。過濾器的容量（150、250、500、1000 毫升）是對平均可過濾的液體量的一般指導。可以通過預過濾或高速離心來減少顆粒。
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