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正確地選擇一種功能恰當的過濾介質或過濾器，不僅確保樣品前處理工藝的完善性，有利于獲得準確可靠的實驗結果，更有利于加速研發過程、創造效益和節約成本。面對如此眾多的 過濾介質和過濾器，如何讓實驗者從“一開始就是正確的"而避免人力物力的浪費。
在某些溶液或溶劑環境下，過濾介質與過濾器外殼的物理化學完整性不會受到破壞的能 力，即化學兼容性。當化學兼容性不佳時，過濾介質暴露于某些化合物中則引發纖維或 顆粒脫落，或因耐溶劑性差而被溶劑溶出，或出現軟化、脆化、變性、溶脹等現象。另外， 與溶劑或溶液的接觸時間長短、溫度、濃度和壓力等因素都可能影響到兼容性。
過濾介質如果對水表現出親和性，理論上可被任何極性溶劑浸潤，絕大多數親水介質也 親和極性有機溶劑，但不一定兼容。如果親水介質不與有機溶劑和腐蝕性溶劑發生反應（如再生纖維素膜/RC 膜），則適用于水相、有機相和腐蝕性溶液；如果親水介質不易與有 機溶劑反應（如尼龍膜），則同時適于水相和有機溶劑過濾。
過濾介質如果憎水，適合過濾有機溶劑或作通風和氣體過濾，這樣水氣不能透過，通常使用 當量孔徑為 1~5um 或更小孔徑的聚四氟乙烯濾膜(TE 或 ePTFE)過濾去除氣體中顆粒物 和水氣。
液體流速實際上受多個因素的影響，特別是被過濾的固體/液體的性質和過濾介質的化 學兼容性。為比較各種過濾介質的性能，要求設定好標準化條件，那么在對過濾介質的濾 速評價時不受顆粒物的附加影響。
它指是過濾介質不斷被加載顆粒物而維持可觀的過濾速度和壓力差的能力。總體上，與具有 同等顆粒截留度的纖維素濾紙相比，玻璃微纖維濾紙因纖維更加細小和比表面積更 大而表現出更高的負載量，而濾膜受厚度和比表面積的限值，其負載量較低一些。“堵塞壽 命"用于表征負載量。
我們都知道，相同的過濾介質對氣體中的顆粒物的去除效率高于對液體中的顆粒物，這 與兩種條件下過濾機制不同有關。通常用對標準顆粒物的穿透率(%)或截留率(%)來表征空氣 濾器的過濾效率。美國采用 0.3μm 的鄰苯二甲酸二辛酯氣溶膠(DOP)檢測空氣過濾介質或濾器是普遍的方法，歐洲基于鈉焰法采用 0.3-0.5μm 氯化鈉顆粒來檢測過濾效率，我國綜 合采用了油霧法和鈉焰法來表征截留效率。
關于用作過濾液體的過濾介質，一般認為>98%的標準顆粒截留效率足以保證次級過濾的 效果。深度過濾器的顆粒截留度是通過被截留的顆粒大小(μm)來進行衡量的，即最初加載于過濾介質或濾器上的具有一定尺度(μm)的顆粒物被截留了 98%以上，就定義該過濾介質 或濾器的顆粒截留度為多少微米(μm)，顆粒截留度=被過濾的標準顆粒的大小。
孔徑評價對所有濾膜都有重要意義，徑跡蝕刻膜 Nuclepore、Cyclepore 和氧化鋁膜 (Anopore 或 AAO) 的孔徑大小(μm)是利用光學顯微鏡或電子顯微鏡觀察測量而來，稱為 “真實孔徑"；其他大多數的微孔濾膜的孔徑大小(μm)是通過泡點法(BubblePoint)來測定， 后者的孔徑具有特定的分布規律，因此稱為“當量孔徑"，即一種間接測量后換算出的孔徑。標稱孔徑(Nominal Pore Size)有的以真實孔徑來表征，有的以當量孔徑來表征， 由于這兩種濾膜的過濾機理差異較大，使用者必須要辨別濾膜的孔徑類型，真實孔徑的結構 一般是上下貫通的柱狀孔，而當量孔徑結構一般是三維無規則縫隙、網狀或層疊的形態。
微孔濾膜材質通常是高分子聚合物制成的具有一定孔徑分布的過濾膜，它不同于深度過 濾介質（棉纖維素和玻璃微纖維濾紙），微孔濾膜的厚度較薄，傾向于表面過濾，材質 不局限于聚合物。微孔濾膜中的徑跡蝕刻膜和氧化鋁膜是一類具有真實孔徑且精確分布的濾 膜，真實孔徑最大可至 12μm，最小可至 20nm 和 15nm。微孔濾膜常用于亞微米顆粒、微生 物體、病毒等收集，其中真實孔徑的表面過濾膜具有更高的回收率。
微孔濾膜根據要過濾的目標特性不一樣，可選用不同材質和不同規格的濾膜，大體上分為：混合纖維素膜，尼龍膜，PTFE膜，PVDF 膜，硝酸纖維素酯膜，醋酸纖維素酯膜，玻璃纖維 膜，聚醚砜膜，聚丙烯膜，聚碳酸酯膜和無機膜。
對于大多數應用，在室溫下過濾溶液沒有問題。通常增加溶液的溫度會增加流速。例如，將 細胞培養基的溫度從 4℃增加至 37℃會使流速加倍。這最可能是由于培養基粘度的下降。但 是，在一些情況下，較低溫度下過濾會增加總通量，對血清等含蛋白質和脂肪的溶液尤其如 此。
對于真空過濾，建議采用 400mm Hg(7.73 psig)的壓差（真空）。再增加壓差只會使流速提 高一點，但是可能導致過量泡沫的形成，因為濾出液中的氣體會從溶液中逸出產生氣泡。在 過濾加入碳酸氫鹽緩沖液的細胞培養基時這個問題尤其突出。在較高的壓差下，培養基中溶 解的二氧化碳將很快逸出，導致 pH 值上升，如果培養基中含有血清蛋白則形成過量的泡沫。
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